Sebelum Madrasah Ibtidaiyah Muhammadiyah Bener Berdiri , terlebih dahulu berdiri Madrasah AL- Iman pada tahun 1942, dan sejak tanggal 15 Januari 1947 Madrasah Al-Iman berubah nama menjadi MI Muhammadiyah Bener sampai dengan sekarang oleh Pimpinan Cabang Muhammadiyah Kepil di sebuah tanah wakaf yang beralamat di Rt. 003 Rw. 002 Dusun Bener Lor Desa Bener, Kecamatan Kepil, Kabupaten Wonosobo
MI Muhammadiyah Bener merupakan sekolah favorite dan sekolah prestasi dengan Akreditasi A, dengan sistem pembelajaran profesional smart religious and fun, fasilitas lengkap & luas.
Madrasah Ibtidaiyah Muhammadiyah Bener Kepil memiliki Pengajar yang Terlatih dan Berpengalaman, Potensi pendidik dan tenaga kependidikan yang dimiliki MI Muh Bener Kepil mendukung untuk membawa kemajuan dan keberhasilan pendidikan Sekolah ini, karena dengan personalia yang ada sekarang ini memiliki kualifikasi dan kompetensi pendidikan yang memadahi.
Bermacam pilihan ekstrakurikuler, Banyak pilihan ekstrakurikuler yang bisa dipilih sesuai dengan keahlian masing-masing siswa. Mulai dari keagamaan, olahraga, dan banyak lainnya. Dan juga semua Ekstrakurikuler MI Muhammadiyah Bener Kepil berprestasi.
Menjadi Sekolah Ramah Anak, Madrasah Ibtidaiyah Bener Kepil Wonosobo sangat ramah terhadap Anak dan nyaman dalam proses belajar baik belajar secara akademik maupun belajar dengan lingkungan sekitar.
Prestasi Sekolah, Madrasah Ibtidaiyah Kepil Wonosobo memiliki banyak Presetasi yang diraih nya baik dalam bidang Akademik maupun Non Akademik. MIM Bener mengoptimalkan fasilitas sekolah untuk menunjang anak dalam proses belajar mengajar.